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Fluidigm, suas análises genéticas em nível single cell

September 18, 2019

a. Genoma de Single Cell

 

A Fluidigm é uma empresa dedicada a tecnologias de ponta para o mercado de Life Science e possui soluções para single-cell. O equipamento C1permite o isolamento e preparo de 96 células individuais para aplicações em genômica descritiva e funcional. A tecnologia de microfluídica permite a aquisição de DNA genômico de 96 células individualizadas para seguir com sequenciamento de genoma total, ou de regiões de interesse ou até mesmo de SNPs para genotipagem. Assim, o C1 garante, de forma simplificada, a viabilização de estudos genéticos de single-cell. 


Veja o que acontece dentro dos IFCs de microfluídica no C1:

 

 

Os pesquisadores estão analisando perfis genéticos de tumores e outras doenças complexas para identificar mutações causais e regulatórias. Essas doenças são frequentemente causadas por mutações somáticas que se originam em células individuais e criam populações clonais geneticamente diversas. À medida que as células mutadas proliferam, elas derivam redes policlonais complexas com populações de baixa abundância que não podem ser totalmente interrogadas nem mesmo pelo sequenciamento massivo. Para associar variantes particulares a populações celulares específicas, cada célula deve ser medida independentemente.

 

O fluxo de trabalho do C1 é a única abordagem no mercado que permite sequenciar o genoma inteiro de células isoladas e de forma abrangente e confiável. Essa ferramenta C1 permite:

  • Descobrir perfis genéticas de populações celulares específicas;

  • Desvendar com profundidade o conteúdo genético populacional, com menor viés e baixa taxa de erro;

  • Realização de estudos de triagem e validação subsequentes a diversas aplicações;

  • Redução significativa dos reagentes com seu protocolo simplificado e otimizado.

 

b. Exoma de Single Cell


O sequenciamento do exoma permite o estudo de regiões codificadoras de proteínas de todos os 22.000 genes que contêm mais de 85% das variantes causadoras de doenças. Os métodos em massa são incapazes de fornecer o contexto clonal de mutações somáticas pouco frequentes, tornando impossível definir perfis genéticas para populações celulares específicas. Sequenciando o exoma de células individuais, você pode revelar a verdadeira heterogeneidade e linhagens celulares presentes em uma amostra.

O fluxo de trabalho no C1 para estudos de exoma permite:

  • Identificar variantes novas ou de baixa frequência no primeiro estágio da abordagem experimental;

  • Fornecer um teste sensível e um fluxo de trabalho fácil para individualizar e processar baixas quantidades de DNA genômico a partir de células únicas;

  • Coletar dados três vezes mais rápido;

  • Oferecer protocolos otimizados que reduzem os custos padrão de reagentes em 6x.

 

c. Targeted sequencing de Single Cell


O fluxo de trabalho de sequenciamento de DNA de célula única Fluidigm fornece o poder de identificar mutações somáticas em genes ou locais conhecidos de populações de células que são indetectáveis em grandes amostras. Esse processo permite novas descobertas sobre heterogeneidade inter-tumor e intra-tumoral, linhagem celular e arquitetura clonal, mosaicismo envolvido em distúrbios autoimunes e predição e progressão de doenças.

 

Em menos de 24 horas, o fluxo de trabalho integrado usando C1, permite o isolamento de células, avaliação de viabilidade, lise, amplificação e preparo de bibliotecas de NGS. Com isso fornecendo:

  • Fluxo de trabalho fácil e sensível para individualizar e processar pequenas quantidades de DNA genômico a partir de células únicas;

  • Descoberta de novas mutações em populações raras de células que são indetectáveis em amostras inteiras;

  • Abordagens que permite identificar mutações nonsense e missense, frameshift, indels e splices.

 

 

Para saber mais sobre essa matéria, fale com um de nossos especialistas, no e-mail suporte@pensabio.com.br ou no telefone: Tel: (11) 3868.6500.

 

 

 

 

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